На территории Югославии имелись и другие части специального назначения вермахта, включавшие в себя подразделения, сформированные из «советских горцев» и действовавшие в составе ФАТ. К концу войны боевой дух этих жителей Кавказа и Средней Азии падал, и дело доходило до дезертирства и массовых возмущений. Было зафиксировано по крайней мере 2 подобных случая, не связанных между собой: азербайджанская часть из состава ФАТ-215, действовавшая в районе Требинье (Восточная Герцеговина) и таджикская из состава ФАТ-207, действовавшая в районе Рашки (пограничье Сербии и Черногории), вырезали немецких командиров и унтер-офицеров и ушли в горы. Кроме того, в антипартизанских операциях в Югославии участвовали и кавказские «восточные» батальоны, придаваемые отдельным дивизиям. На территориях югославско-албанской границы и присоединенного к Албании Косова действовал I/125-й армянский пехотный батальон. На территории Хорватии и Боснии в антипартизанских операциях участвовали 842-й и 843-й северокавказские усиленные полубатальоны и 814-й армянский пехотный батальон.
Помимо кавказских народов, на Балканы для борьбы с партизанами прибыли и туркестанские части вермахта. Крупнейшей из них была 162-я туркестанская дивизия, в которой немецкую форму носили казахи, узбеки, таджики, туркмены, калмыки и азербайджанцы. Предыстория формирования этой части относится к маю 1943 г., когда в Нойхаммере была сформирована экспериментальная 162-я туркестанская пехотная дивизия под командованием генерал-майора Оскара фон Нидермайера. Дивизия имела в своем составе около 50 % немцев, значительная часть которых была «фольксдойче» из СССР. После формирования и обучения в сентябре 1943 г. эта часть прибыла в Югославию, где и участвовала в антипартизанских операциях в Словении, Хорватии и Боснии. Основная часть дивизии была сконцентрирована в Истрии (Хорватия)и после капитуляции Италии была усилена захваченным немцами у итальянцев вооружением для борьбы в горных условиях. Дивизия два раза в течение 1944–1945 гг. отходила на фронт, на Апеннинский полуостров (в Италию) для борьбы против наступавших союзников. Легионеры туркестанской дивизии отличались низким уровнем дисциплины, однако их жесткость по отношению к местному населению делала их часть полезной для карательных операций и для антипартизанских операций местного значения.
Представитель вермахта в НГХ генерал Глейз фон Хорстенау описал в своих дневниковых записях состоявшуюся 28 сентября 1943 г. встречу с генералом Оскаром фон Нидермайером, прибывшим в Хорватию вместе с 162-й дивизией. Из Нойхаммера части 162-й дивизии были переброшены в Италию (в Удине и Верону) и в Хорватию (в Загреб). Части, прибывшие в Загреб, выдвигались из района Карлоцац-Огулин в направлении на северо-запад. Г. Хорстенау записал краткую характеристику, которую Нидермайер дал своему воинству: «Каких-то политических идеалов, разумеется, мы не можем им дать. Они чувствуют верность только к своему командиру. Они наемники, которые хотят хорошо есть и пить, и им очень важны женщины. Когда им приказываешь, необходимо обещать им эти три вещи. И только тогда они идут в бой». Нидермайер, по его словам, выбрал из 40 тысяч человек, прибывших в Нойхаммер, 10 тысяч самых лояльных, остальные места в дивизии были заняты немцами. По свидетельству Хорстенау, практика 162-й дивизии выглядела следующим образом: «Села, которые они захватывают, немецкое командование разрешает им свободно ограбить. Когда они входят в захваченное село, мужчин убивают, женщин насилуют, а все имущество принадлежит им». Будущий «святой из НГХ» и архиепископ ЗагребскийАлоизий Степинац жаловался генералу Хорстенау на поведение 162-й дивизии. Он позвонил генералу «в отчаянии: туркестанцы, бывшие под командованием Нидермайера, опустошили его родное село Крашич и увели с собой три сотни “полностью невинных, хороших людей”. Он просил… помочь хотя бы, чтобы они не были убиты. Он также упомянул, что между уведенными людьми, вероятно, есть и его родственники…».
В антипартизанских операциях на Балканах участвовали и менее масштабные части, чем 162-я туркестанская дивизия. Сюда были перемещены также 789-й и I/76 — й туркестанский батальоны; 804, 806, 820, I/4, I/101, I/73-й азербайджанские батальоны. Когда передовые части осенью 1944 г. вошли на территорию РККА в приграничном дунайском городке Дони-Милановац, они натолкнулись на 786-й туркестанский батальон.
Существовала тенденция включить находившиеся на юго-востоке Европы батальоны в состав 162-й туркестанской дивизии. Существовал план концентрации в конце 1944 г. на югославской территории всех туркестанских и кавказских частей со всей оккупированной немцами Европы и создания на базе этих частей «Кавказской освободительной армии» и «Национальной армии Туркестана». Однако собрать мелкие части, рассеянные от Ла-Манша до Варшавы, в условиях последнего года войны было невозможно, что и обрекло эту идею на провал. Позднее немцы решили создать из азербайджанских, северокавказских, армянских и грузинских частей, уже сконцентрированных на территории Словении и Хорватии, кавказскую конную бригаду СС, но и эти планы не были осуществлены из-за капитуляции Германии. В самой крупной на территории Югославии битве Второй мировой войны — битве за Батинский плацдарм — советским войскам противостоял некий «татарский батальон», 11 ноября 1944 г. мешавший свои огнем переправе через Дунай частям 703-го стрелкового полка 233-й стрелковой дивизии.