Кроме попыток вступить в контакт с русскими людьми на Родине, РПЦ(з) продолжала исполнять свои пастырские обязанности по отношению к верующим из рядов русской эмиграции. Помимо этого РПЦ(з) открыла в Русском доме курсы анти-атеистических пропагандистов, которые вели многие известные лекторы, а также курсы иконописи под руководством иеромонаха Антония Бартошевича. Владыка Анастасий уделял большое внимание воспитанию молодежи и неоднократно посещал Кадетский корпус в Белой Церкви, где Закон Божий преподавал всесторонне одаренный и любимый учениками иеромонах Антоний (Бартошевич). Посещал митрополит Анастасий и русскую гимназию в Белграде, где Закон Божий преподавал прославленный богослов Георгий Васильевич Флоровский. Владыка посещал и традиционную рождественскую елку для детей малоимущих русских эмигрантов. РПЦ(з) участвовала и в помощи престарелым и ослабевшим представителям русской эмиграции, чье количество по объективным причинам возросло в годы войны. Храмы РПЦ(з) действовали при русском Доме престарелых в г. Кикиндеи при русском Доме престарелых в Белграде (в районе Вождовац) , а также при русском госпитале в Панчево. Все эти приходы владыка Анастасий посещал и по мере сил пытался оказывать им необходимую помощь и поддержку. Благословение и внимание митрополита Анастасия привлек и еще один проект русской эмиграции — совместное сельскохозяйственное имение на Банице, где в поисках выхода из тяжелых сложившихся условий люди занимались совместными сельскохозяйственными опытами для обеспечения себя продовольствием.
Синод РПЦ(з) с пониманием относился к тяжелому положению, в котором оказалась СПЦ, чей патриарх был арестован немцами, а значительная часть владык погибли или были насильственно отделены от своей паствы. Уже после войны Ю.П. Граббе вспоминал, как митрополит Анастасий пытался поздравить с церковным праздником патриарха Гавриила и епископа Николая (Велимировича), несмотря на сопротивление немецких властей и изоляцию, в которой оказались эти сербские духовные лидеры. Последовательную и честную позицию заняла РПЦ(з) и по вопросу о «хорватской православной церкви» («хпц»), основанной в 1942 г. Из 62 клириков «хпц» в 1942 г. 20 человек были русскими, в том числе ее глава Григорий Иванович Максимов (митрополит Гермоген). Как только митрополит Анастасий получил сообщение о возникновении этого проекта усташских властей, он незамедлительно выразил по этому поводу свое отрицательное мнение. Митрополит Анастасий сразу резко осудил и поведение Гермогена, о чем РПЦ(з) поспешила сообщить СПЦ (об этом и письменно, и устно оповестили местоблюстителя Патриаршего престола митрополита Иосифа). Немцы запретили публиковать сообщения об этой реакции РПЦ(з) в газетах, но пастыри РПЦ(з) на проповедях донесли до прихожан воззрения главы церкви по вопросу о «хорватской церкви». Эта последовательность и преданность сестринским отношениям с СПЦ не остались незамеченными и в СПЦ. После окончания войны патриарх Гавриил во время своего пребывания в Лондоне заявил, что «митрополит Анастасий с большой мудростью и тактом вел себя во время оккупации и всегда был лоялен к сербам».
Политические и личные взгляды начальника канцелярии Синода Ю.П. Граббе, выраженные в положительной оценке личности и политической деятельности Д. Льотича и М. Недича как непримиримых борцов с коммунизмом в Сербии, совпадали с воззрениями значительной части русского священства, проживавшего в Сербии. Эти же позиции в дальнейшем выразились в участии священников РПЦ(з) в церковной жизни русских воинских формаций в Югославии, а в конце войны — в установлении связей с РОА и самим генералом Власовым. Эти связи были настолько крепкими, что осенью 1944 г. митрополит Анастасий часть своего пути по Германии и Чехии проделал в штабном автобусе генерала Власова. Установились сердечные связи между руководством РОА и старейшинами РПЦ(з), особенно важной была первая встреча митрополита Анастасия и генерала Власова. В ноябре 1944 в огромном русском православном соборе в Берлине, построенном при поддержке немецкого государства в тридцатые годы, состоялся торжественный молебен «за победу русского оружия», которым предводительствовал прибывший незадолго до этого из Белграда митрополит Анастасий.
После начала гражданской войны в Сербии последовательные антикоммунистические взгляды выражали и проповедовалиа значительная часть русского священства, служившего в приходах СПЦ в сербской провинции. В результате многие из них, так же как и их единомышленники из рядов сербского священства, пали от рук партизан. Сравнительно большое число русских священников, убитых партизанами, не могло не вызвать внимания официального издания РПЦ(з) .
Отметим, что число русских православных священнослужителей, погибших в годы Второй мировой войны в Югославии от рук партизан, является достаточно заметным. На основании послевоенных исследований СПЦ можно сделать заключение, что от рук оккупантов и их помощников погибли шесть человек: четверых убили усташи в НГХ (о. Бориса Мулева в августе 1941 г. у г. Слунь, о. Андрея Семилуцкого в октябре 1941 г. у г. Пакрац, о. Ивана Княжева в декабре 1941 у г. Брчко, о. Михаила Гутовского 7 января 1942 у г. Карловац), а двоих по неясным причинам убили сами немцы в конце войны в Воеводине (протодьякона Ивана Котова 11 апреля 1944 в г. Алибунар, иеромонаха Платона Бондаря 23 октября 1944 в с. Врдник). Некий русский монах Вениамин, игумен монастыря Св. Наума в Македонии, был убит неизвестными людьми в районе Охрида. Кроме этих жертв немцев и их союзников, двух священников якобы убили боевики Д. Михайловича — протоиерея Валериана Бортинского в с. Рипань у Белграда 7 декабря 1943 г. и о. Иосифа Брагина в июле 1942 в с. Лазница у Браничева.